控机器人的攻击，在遗迹塔上找到鹰形徽章（在楼梯墙壁的后方）。得到两块徽章后，里昂向克劳瑟索要第三块徽章，而克劳瑟则使用寄生兽的力量，将左手变成一只坚硬的翅膀。这时，克劳瑟安置在遗迹塔上即将爆炸，里昂在有限的时间内，通过袭击克劳瑟的双脚来杀死他，并从他身上搜出第三块徽章。最后，里昂迅速将三块徽章镶入壁画石门上，离开即将炸毁的遗迹外围。
第四关
与克劳瑟大战之后，萨德勒通过通讯器前来道谢，感谢里昂帮他清除了心头大患，其实他一早就察觉到克劳瑟在打样本的注意，因此特意利用他来绑架阿什莉和对付里昂。随后，里昂来到一个军事营地前沿，发现那里聚集了大批的雇佣兵。这时，军方派出的直升飞机及时赶到，它疯狂地向地面扫射，还不时发射导弹炸毁地面的机枪炮，里昂在强大火力的掩护下冲进营地，摧毁了里面的四门机枪炮，并爬上铁架台，拉动两侧的开关，从开启的铁门离开营地。接着，里昂沿着山道走到营地后方的悬崖上，被埋伏在此地的雇佣兵包围，多亏支援的直升飞机帮他脱险，但它却被萨德勒的一名手下用火箭筒炸毁了，愤怒的里昂发誓要为死去的迈克报仇。
在悬崖右侧的遗迹里，爱达打算上前安慰里昂，但没想到对方突然失去控制，掐住了自己的脖子，爱达奋力反抗之时掏出一把匕首，往里昂大腿上插上一刀，痛苦大叫的里昂得以清醒过来，爱达建议他先去救出阿什莉，再去清除体内的寄生兽。之后，里昂穿过监狱走廊来到实验室外层，发现通往实验室的门被锁上了，当他开启其中一个开关时，一名雇佣兵却关上了开关电源，并带走了磁卡，里昂只好强行将磁卡夺走，用它来接通电源，通过开启两个开关来打开实验室的大门。
进入实验室，里昂只看到阿什莉被冷冻在仪器里，却没察觉到萨德勒出现在身后，萨德勒瞬间将他撞翻在地，幸亏躲藏在一旁的爱达及时出手阻止萨德勒继续攻击，否则后果不堪设想。在爱达的掩护下，里昂救出阿什莉，并带着她逃离了实验室。来到附近的手术室，两人用仪器清除了体内的寄生兽……

最终章
清除完体内的寄生兽后，里昂带着阿什莉向平台走去，他发觉气氛不对头，便让阿什莉留在下面，自己一人乘坐电梯前往平台。抵达平台后，里昂看到了被萨德勒吊在半空中的爱达，而萨德勒试图控制里昂体内的寄生兽，却不知他已经把寄生兽清除了。随着一声冷笑，变身成一个巨大的怪物，举起锋利的前肢不断刺向里昂。经过几回合的战斗，里昂似乎找到了对付的方法，只见他先攻击四肢上的眼睛，令其张开头部的眼睛，然后再集中火力攻击这只眼睛。没过多久，萨德勒便倒下了，里昂在地上捡起了萨德勒的样本。这时，爱达突然拿出枪对准里昂的头部，威胁他交出样本，无可奈何的里昂只好拱手相让，爱达拿到样本后立即乘坐直升飞机离开小岛，她临走时还启动了安置在孤岛的定时炸弹，不过也丢了把钥匙给里昂，让他自行解决。
得到钥匙之后，里昂立即乘坐电梯回到地面，带着阿什莉逃往地下河道，并驾驶爱达留下的摩托快艇向岛外驶去。随着几声巨响，整个孤岛在爆炸声中被夷为平地，里昂和阿什莉安全地脱离了危险，向着黎明的阳光驶去。
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