当淳浩天醒来时发觉自己在一个陌生的世界，地上放着一把奇特的剑。一个好似幽灵的姑娘飘过来让他跟着走，向上进入一个大殿和周围的人对话后从上面的口离开。这里囚禁着剑灵，淳浩天得知自己已死，并被赋予了平息战火、拯救众生的使命，只有集齐五行珠用在刚才拣到的修罗剑上才能接触剑灵身上的封印。在回到人间之前，还需要修炼丹心和剑心，在侍剑的陪同下来到大厅左边的地区修炼丹心，接着去大厅右边的地区修炼剑心，之后回到剑灵处进入时空隧道。

刚回到人间，淳浩天就被御剑门抓获，在大厅里得知自己已经离开了五年，被诬陷为御剑门的叛徒，心上人司徒毓湘早已改嫁他人并生儿育女。被关进天牢的淳浩天无法接受这样的事实，但侍剑告诉他这是千真万确的。司徒毓湘走来打开牢门放淳浩天走，二人彼此吐露思念深情。在御剑门的后山被南林天、南林彻阻截，情急之下的司徒毓湘一剑刺入淳浩天胸口并把他打下山崖……

在桦榛村河岸边，一群少女在玩耍时发现了淳浩天的尸体，其中一名叫华怡琳的姑娘发现他奄奄一息，于是众人将淳浩天抬回村中请名医华左医治。数日后淳浩天苏醒，华左告诉他今日的境况，淳谎称自己名为司徒莫言（以后的游戏一直是这个称号），之后得知救命恩人是华左的孙女。来到桦榛村河岸边找到华怡琳致谢，她害羞的说还要去药铺帮忙然后就跑开了。来到药铺时，伙计请淳浩天转告华左最近深山老林里常有妖兽出没，因此无人上山采药导致了药材短缺。回到华左家中说明此事并称自己知晓炼丹的一二，可以帮助华左采药，华怡琳意欲同往，遭到拒绝后离开房间。在上山途中遇见华怡琳，她执意要和淳浩天同行，无奈之下只好同意。打败妖兽后可以得到一些药材，当达到华左要求的数量时即可下山。回去后华左责备怡琳任性妄为，命她去药铺一个月不得离开，淳浩天也跟着来到药铺，把药交给伙计后得到奖励。在药铺外面，淳浩天向怡琳表示希望远离纷争，在此世外桃源略尽微力，怡琳高兴的去帮他安排住处了。

半年后，淳浩天在铁匠铺听说这里的铸剑术是数百年前灵剑门流传下来的，他说明自己略懂铸剑技术，之后铁匠传授基本铸剑并他请求淳浩天帮忙收集铸剑材料，如果答应就得去山谷的矿场，事后得到重铁剑、医针和经验值的奖励；如果不去也对主线无影响。在广场有一个自称是临同镇的使者前来求见村长，原来是临同镇的居民大多身中奇毒，故特此来请华左大夫前去医治。村长带领使者来到华左家说明此事，华左同意前去。之后淳浩天也愿意同往，怡琳虽有此意但被华左责备，在淳浩天的劝说下才得到同意。在村长家里，华左嘱咐完他二人先行离开，淳浩天和怡琳随后赶到。在临同镇镇长的家中，华左要他二人制作净毒丹以暂时控制病情，之后得知客栈里有一名天剑门的弟子也中了毒。来到临同镇客栈，给那名弟子服用净毒丹，当他清醒后得知他是奉命前来调查这起中毒现象的服朔风，朔风说自己曾上过狐山，并受到了往日不主动攻击人类的狐妖进攻，而且山上的妖气与日俱增，下山后就卧床不起了。

回到临同镇镇长家把净毒丹分发给其它大夫，华左认为中毒是水源发生了异常，之后独自前往狐山的水源地。侍剑显身说这里的魔气相当严重，事态虽然严重，但她却冷淡的表示自己不会理睬与五行珠和修罗剑无关的事情。淳浩天和怡琳担心华左急忙奔上狐山，却在山路上找到了华左的尸体，怡琳伤心欲绝，淳浩天发现了华左手里的解毒秘方和地上有上山的脚印。华怡琳只身跑向山顶，淳浩天跟了上去，在狐山破庙找到怡琳之后消灭雄千年妖狐。回到临同镇镇长家把药方交给大夫，镇长善待华左的后事，来到客栈的房间里，淳浩天决心把怡琳当成亲妹妹一样照顾。服朔风伤愈来向两人道谢并希望能合力消灭狐妖，淳浩天和怡琳欣然同意。朔风猜测狐山上必有狐妖的巢穴，但之前却没找到。去镇长家询问得知有一叫麻七的猎户应该知道这些。和镇内村民对话得知麻七的住处，找到他后得知狐穴在狐山破庙的后院里。众人直上狐山，进入狐穴后下到地下三层碰到雌千年妖狐，合力杀死它后怡琳想起了惨死的爷爷不禁哭泣。淳浩天与服朔风发现一封已撕碎的书信，内容虽不能辨认但是在破片中却提及了“御剑门”。狐妖用尽力气在临死前将洞头掩埋，朔风施展气功炸开一个出口，三人死里逃生，出去后相视大笑。出口正好离凌霄城不远，朔风说自己还有要事在身，于是告辞离开了。淳浩天和怡琳搭起篝火，两人偎依在一起想起之前的经历不免伤感起来，远处亭亭玉立在树枝上的侍剑静静的看着前方。

来凌霄城门口，怡琳为了追忆爷爷决定在此悬壶济世三天，淳浩天可以选择是否协助。此处为支线剧情，不会影响主线，如果选择“愿意协助”那么在完成时淳浩天可以增加经验值，而怡琳则等级加一；如果选择“给华怡琳自己表现”那么完成时只会增加怡琳一个人的经验值。另外这三天在怡琳的临时药铺旁会出现一个不戒僧，淳浩天与他对话得知自己命克至亲，最好潜心退隐造>