之后，渴望自由的市民们迅速武装起来推翻了秘密警察的法西斯统治。
    不久之后波尼尔德的默示录组织因为协助消灭主教而被愤怒的超级变种人大军彻底消灭，波尼尔德连同它以前的旧名洛杉矶一起从地球上消失了……（该城在辐射二代中未出现）

    变种人培养基地（Military Base）——病毒槽(Vats)：被超级变种人占据的小型军事基地，战前就是美国政府培育病毒武器FEV病毒的基地。一大群火力强劲的变种人军队守卫着它。在基地里面有被称为“神的右手”的超级变种人中尉，还有很多为邪教大教堂组织服务的科研人员。在看到中尉被干掉后，这些邪教徒竟然集体自杀了。加入钢铁兄弟会的年轻英雄们引爆了这个基地。80年之后，年轻英雄的子孙会再次拜访病毒槽(Vats)，来访者惊奇的发现英克雷军已经先来一步了，再留下大量尸体之后狼狈的退出了基地，并将入口封住。当年教主所残留的超级变种人军队依然还存活着，他们竟然仅靠捕食老鼠就坚持了这么多年，生命力之强令人不寒而栗。

    大教堂（Cathedral）& 不知名的避难所（Vault X）：是邪教组织大教堂的大本营，在大教堂的下面就是第十避难所。大教堂组织的首脑叫教主（Master）他诱骗那些愚昧的人们加入教会，并改造成为超级变种人。他宣称自己是神，而超级变种人就是神的左右手。教主打算将所有的核战幸存者们都改造成超级变种人，因此他指挥着自己的大军踏平了那些不服从他的城市。
    默示录组织提供了人力支援，并且还派出一个卧底的女间谍劳拉混入教主的大本营中。年轻英雄们由劳拉带路混进了大本营，随即一场血雨腥风的惨烈战斗又展开了。这里到处都是手持能量武器的超级变种人，默示录组织的支援人员很快就被变种人的重武器杀戮殆尽。只有身经百战的年轻英雄靠着智慧和勇气杀到了一个不知名的核子避难所。
    最终的决战展开了，在避难所的第四层年轻英雄找到了一台特殊的电脑，开启它之后经过300秒就会引爆核弹摧毁避难所。于是年轻英雄和他的朋友们争分夺秒的冲开最后的大门来到教主的面前。教主拥有心灵控制和精神攻击的独特本领，极为危险，他的身后还有无数像狗般忠诚的超级变种人战士做援兵。生存还是毁灭？这是一个严肃的话题。如果偷偷溜出去的话一样可以利用核弹消灭主教，但是看着散布在空气中的呻吟和遍布的培养槽中因变异失败而流淌出的无数人类肢体和器官……年轻英雄无言的攥紧了手中的枪……
    在基地电脑的倒计时读秒声和枪声的共鸣曲伴奏下，教主和他的军队在惨叫中倒在自己制造的人肉海洋之中。还有200秒……100秒……50秒……
    终于，几个熟悉的身影奔出了避难所大门飞一般的逃离了爆炸区域，接着大地仿佛被针刺痛的刺猬一样猛地一缩，无数闪光和火焰从地底喷出，就像末日审判一般的核火再次被点燃。随着一声巨响之后，避难所内的主教和他的信徒以及超级变种人的大军都被这核火所锻造的恶魔之手拉进了地狱最深处……主教死去了，他的超级变种大军也随之崩溃。被征服的城市一个个获得了解放，主教的野心只持续了不足300天……（该地在辐射二代中未出现）


    《辐射二代》中的地区和各派势力：

    阿罗由（Arroyo）：同上。

    克拉玛斯（Klamath）：是一个是一个偏僻的村庄，村民以畜牧、打猎维生。从前到阿罗由部落卖水壶的威克（Vic） 在此地有一个小店面，但最近不知为何都没有回来。这里有不少村民同样来自原始部落。包括牧牛的托尼（Torr），和在旅店工作还债的史力克（Sulik）。村中有稍微黑暗的一面，如兼营色情行业的浴室、会偷牛的丹特（Dunton）兄弟，和一间龙蛇杂处的酒店。这些人拥抱黑暗势力的结果，就是在猎人聚集的地区来了一只变种的大老鼠。它的徒子徒孙从地底扩充到地面，并且凶狠的攻击人类，迫使这些猎人们不得不把那一整个地区封闭起来。如果能救回资深的蜥蜴猎人斯迈勒（Smiley）就能够从他那里学到扒蜥蜴皮的手艺，这可以为旅程筹措一些旅费（在二代中钱币已经是拉环而不是瓶盖了）。在闹鼠患的区域中可以找到一部破车，那上面有动力稳定器（a Full Cell Regurater）这是日后组装轿车的重要>